上世纪60 年代初，食品学院在我国最早进行本学科研究生的培养，至今已培养研究生2200多人（其中博士生320多人），出站博士后10人，他们中绝大多数已成为食品科技领域的中坚。目前，学院拥有一级学科博士学位授权点（食品科学与工程） 1 个，二级学科博士学位授权点（动物营养与饲料科学） 1 个，二级学科硕士学位授权点（营养与食品卫生） 1 个，博士生导师60名（包括外聘导师），硕士生导师48名，每年招收硕士研究生约280名，博士研究生约60 名。现有在校研究生约 800 人，外国留学研究生40多人。

目前我院食品科学与工程博士后流动站与企业合作在河南双汇集团、湖南金健米业、浙江海通集团和南海油脂工业（赤湾）有限公司建有博士后工作站。